De milieueisen voor biologische productie zijn ambitieus, zie EU-biologisch. Biologische bedrijven gebruiken geen synthetische bestrijdingsmiddelen. Ze weren ziekte, plagen en onkruid met teeltmaatregelen. Ook gebruiken ze geen kunstmest. De dieren krijgen biologisch voer. Een minimumhoeveelheid voer moet van het eigen bedrijf of uit de regio (EU) komen (minimaal 60% bij runderen, 30% bij pluimvee en varkens). Daardoor blijft de import van veevoer en eventuele daarmee gepaard gaande tropische ontbossing beperkt. 

EU-Biologisch stelt geen eisen aan beperking van broeikasgasuitstoot of energiegebruik, hoewel bijvoorbeeld het verbod op kunstmest deze indirect wel beperkt. Het EKO-keurmerk stelt groene stroom wel verplicht als energie wordt aangekocht. 

Het aantal dieren per grondoppervlak moet zodanig zijn dat de schade aan de bodem door de dieren en hun mest minimaal is. Het maximale aantal dieren is ook beperkt om een te hoge stikstofuitstoot te voorkomen. 

Ten aanzien van dierenwelzijn is EU-biologisch gelijkwaardig aan Beter Leven 3-sterren. EU-Biologisch en EKO krijgen daarom dezelfde score voor dierenwelzijn. Dieren hebben een comfortabele huisvesting, zowel binnen als buiten, met voldoende ruimte en middelen voor soorteigen gedrag. Gezondheidsproblemen die vaak optreden bij intensieve veehouderij moeten worden vermeden. Intensieve opfok is niet toegestaan. EKO stelt ook een maximum aan de transporttijd van dieren.